Różnice między wybraną wersją a wersją aktualną.
Both sides previous revision Poprzednia wersja Nowa wersja | Poprzednia wersja Nowa wersja Both sides next revision | ||
odra [2013/05/24 11:09] zozlak [Mplus] |
odra [2014/05/14 23:07] zozlak [Dostępne oprogramowanie] |
||
---|---|---|---|
Linia 8: | Linia 8: | ||
===== Dostępne oprogramowanie ===== | ===== Dostępne oprogramowanie ===== | ||
- | * R 3 | + | * R 3.1 |
- | * Stata 12 - niestety tylko 1-rdzeniowa; | + | * Stata 13 |
- | * Mplus 7 - w porozumieniu z Tomkiem Żółtakiem (bo to jego prywatny) | + | * Mplus 7.12 |
+ | * Jags 3.4.0 | ||
====== Dostęp ====== | ====== Dostęp ====== | ||
Linia 22: | Linia 23: | ||
**Aby korzystać z serwera niezbędne jest założenie konta** - w tym celu skontaktuj się z Mateuszem Żółtakiem (m.zoltak@ibe.edu.pl) | **Aby korzystać z serwera niezbędne jest założenie konta** - w tym celu skontaktuj się z Mateuszem Żółtakiem (m.zoltak@ibe.edu.pl) | ||
- | ===== Jak połączyć się przez SSH i uruchomiać programy? ===== | + | ====== Jak korzystać z serwera przez SSH/SFTP? ====== |
- | ===== Jak przesłać pliki przez SFTP? ===== | + | Poniżej znajduje się zestaw porad dla początkujących użytkowników. |
- | ===== Jak uruchomić obliczenia, by nie zostały przerwane w momencie zakończenia sesji SSH? ===== | + | ===== Problemy wynikające z różnic między systemami operacyjnymi ===== |
- | ====== Uwagi do oprogramowania ====== | + | Odra działa pod linuksem, który od Windowsów różni się w kilku uciążliwych szczegółach: |
+ | * [[znaki_nowej_linii|sposobem zapisu znaków końca nowej linii]]; | ||
+ | * [[kodowanie_znakow|kodowaniem znaków narodowych]]; | ||
+ | * [[notacja sciezek|sposobem notowania ścieżek do plików]]. | ||
+ | Aby bezproblemowo przenosić i wykonywać skrypty pomiędzy swoim komputerem a odrą, trzeba zdawać sobie sprawę z tych różnic i stosownie je przygotowywać. | ||
- | ===== Mplus ===== | + | ===== Podstawowe czynności ===== |
- | - Aby skorzystać z wielordzeniowości w Mplusie pod linuksem, należy dopisać do sekcji **ANALYSIS** pliku //.inp// polecenie <code>PROCESSORS IS liczbaRdzeni;</code> | + | * [[polaczenie_ssh|Łączenie się przez SSH]] |
- | - Testy wykazały, że zwiększanie liczby rdzeni ponad 5 nie daje już prawie żadnego skrócenia czasu wykonywania obliczeń i **optymalna liczba rdzeni to od 3 do 5** (co pozwala skrócić czas obliczeń, podczas których Mplus wykorzystuje wielordzeniowość do, odpowiednio ok. 55%, 44%, 38% czasu ich wykonywania na jednym rdzeniu) | + | * [[konsola_kopiowanie|Kopiowanie i wklejanie na konsoli]] |
+ | * [[konsola_autouzupelnianie|Autouzupełnianie na konsoli]] | ||
+ | * [[konsola_znaki_specjalne|Wprowadzanie znaków specjalnych (spacji, cudzysłowów, itp.) na konsoli]] | ||
+ | |||
+ | * [[sftp|Przesyłanie plików i katalogów przez SFTP]] | ||
+ | * [[operacje_na_plikach|Operacje na plikach i katalogach na serwerze]] | ||
+ | |||
+ | * [[konsola_pomoc|Uzyskiwanie pomocy na konsoli]] | ||
+ | |||
+ | * [[uruchamianie_programow|Uruchamianie programów]] | ||
+ | * [[screen|Uruchamianie programów tak, by nie kończyły działania wraz z zamknięciem sesji SSH]] | ||
+ | * [[konczenie_dzialania_programow|Kończenie działania programów]] | ||
+ | * [[zuzycie_zasobow|Obserwowanie zużycia zasobów]] | ||
+ | * [[konsola_skrypty|Uruchamianie kilku poleceń jedno po drugim]] | ||
+ | * [[powiadomienia_mailem|Powiadamianie o zakończeniu pracy programu mailem/sms-em]] | ||
+ | |||
+ | * [[edycja_plikow|Edycja plików]] | ||
+ | |||
+ | ====== Uwagi do oprogramowania ====== | ||
+ | * [[Mplus]] | ||
+ | * [[JAGS]] | ||