BUGS i OpenBUGS są trefne!!!
Tak się stało, że BUGS został napisany w martwym języku programowania. Martwym, tzn. takim, że:

• nie ma programistów, którzy umieją w nim programować;
• nie ma środowisk programistycznych (w szczególności nie ma żadnego debugera) wspierających pisanie w tym jęzuku;
• prawie nie ma kompilatorów tego języka, a te, które są, trudno traktować poważnie.

Powoduje to, że:

• BUGS-a obecnie nikt nie rozwija i nie poprawia błędów, które zostały w nim znalezione;
• BUGS (jak sama nazwa wskazuje) zawiera błędy;
• BUGS ma skopaną arytmetykę zmiennoprzecinkową i/lub indeksowanie tablic wielowymiarowych:
  • Filip dysponuje prostym, a działającym na wyobraźnię przykładem, gdzie naprawdę proste obliczenia sypią się niemiłosiernie.

JAGS to generalnie BUGS przepisany do współczesnego języka programowania (C++) dla którego istnieją:

• programiści;
• środowiska programistyczne, debugery, freymworki, itp.;
• sprawdzone kompilatory.

JAGS posługuje się tym samym językiem, co BUGS (skrypty Filipa napisane pod BUGS-a działały pod JAGS-em bez żadnych zmian).

Istnieją pakiety umożliwiające wywoływanie JAGS-a z poziomu R (gdzie łatwiej sobie przygotować dane i potem obrobić wyniki).